Méthodes multiblocs pour l'identification de gènes associés au vieillissement cutané chez 502 femmes caucasiennes adultes

Anne Bernard (1, 2) , Arthur Tenenhaus (3) , Jean-François Zagury (4) , Gilbert Saporta (1) , Christiane Guinot (2)

1 CEDRIC - Centre d'études et de recherche en informatique et communications
2 CERIES - CENTRE DE RECHERCHES ET D'INVESTIGATIONS EPIDERMIQUES ET SENSORIELLES
3 E3S - Supélec Sciences des Systèmes
4 GBA - Laboratoire génomique, bioinformatique et applications

Une étude a été conduite sur 502 femmes afin d'identifier des gènes ayant un impact sur le vieillissement cutané. Des données générales et phénotypiques ont été recueillies ainsi qu'un échantillon de sang pour les analyses génétiques. La sévérité du photovieillissement et de 12 signes de vieillissement cutané ont été appréciés à partir de photographies numériques du visage grâce à des échelles photographiques ordinales. Trois scores ont ensuite été calculés à partir de ces signes de vieillissement. Les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) génotypés ont permis de répertorier 15198 gènes pour chacune des 502 femmes. L'analyse des liens entre ces gènes, les scores et le photovieillissement a été réalisée à l'aide d'une méthode multiblocs associée à une méthode de rééchantillonnage (bootstrap) afin de sélectionner les SNPs les plus significatifs au sein de chaque bloc. Les blocs de gènes contenant le nombre de mutations alléliques par SNPs sont les variables explicatives, et les scores et le photovieillissement sont les variables à expliquer

Domaines: Applications [stat.AP]

Anne Bernard, Arthur Tenenhaus, Jean-François Zagury, Gilbert Saporta, Christiane Guinot. Méthodes multiblocs pour l'identification de gènes associés au vieillissement cutané chez 502 femmes caucasiennes adultes. EGC 2012, Jan 2012, Bordeaux, France. pp.555-556. ⟨hal-00750918⟩